ศูนย์ฝึกพาณิชย์นาวี มีอํานาจหน้าที่ดังต่อไปนี้ 
(1) ดําเนินการเกี่ยวกับการผลิต ฝึกอบรมและพัฒนาคนประจําเรือ รวมทั้งบุคลากร ด้านการพาณิชยนาวี 
(2) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับ มอบหมาย